Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ddb2Q99J79 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ddb2Q99J79 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ddb2Q99J79 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ddb2Q99J79 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ddb2Q99J79 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ddb2Q99J79 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ddb2Q99J79 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ddb2Q99J79 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ddb2Q99J79 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ddb2Q99J79 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ddb2Q99J79 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ddb2Q99J79 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ddb2Q99J79 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ddb2Q99J79 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ddb2Q99J79 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ddb2Q99J79 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ddb2Q99J79 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ddb2Q99J79 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ddb2Q99J79 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ddb2Q99J79 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ddb2Q99J79 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ddb2Q99J79 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ddb2Q99J79 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ddb2Q99J79 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ddb2Q99J79 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ddb2Q99J79 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ddb2Q99J79 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ddb2Q99J79 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ddb2Q99J79 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ddb2Q99J79 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ddb2Q99J79 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ddb2Q99J79 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ddb2Q99J79 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ddb2Q99J79 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ddb2Q99J79 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ddb2Q99J79 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ddb2Q99J79 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ddb2Q99J79 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ddb2Q99J79 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ddb2Q99J79 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ddb2Q99J79 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ddb2Q99J79 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ddb2Q99J79 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ddb2Q99J79 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ddb2Q99J79 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ddb2Q99J79 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ddb2Q99J79 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ddb2Q99J79 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ddb2Q99J79 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ddb2Q99J79 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ddb2Q99J79 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ddb2Q99J79 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ddb2Q99J79 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ddb2Q99J79 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ddb2Q99J79 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ddb2Q99J79 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ddb2Q99J79 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ddb2Q99J79 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ddb2Q99J79 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ddb2Q99J79 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ddb2Q99J79 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ddb2Q99J79 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ddb2Q99J79 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ddb2Q99J79 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ddb2Q99J79 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ddb2Q99J79 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ddb2Q99J79 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ddb2Q99J79 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ddb2Q99J79 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ddb2Q99J79 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ddb2Q99J79 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ddb2Q99J79 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ddb2Q99J79 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ddb2Q99J79 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ddb2Q99J79 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ddb2Q99J79 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ddb2Q99J79 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ddb2Q99J79 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ddb2Q99J79 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ddb2Q99J79 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ddb2Q99J79 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ddb2Q99J79 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ddb2Q99J79 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Ddb2Q99J79 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Ddb2Q99J79 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Ddb2Q99J79 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ddb2Q99J79 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ddb2Q99J79 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ddb2Q99J79 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ddb2Q99J79 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ddb2Q99J79 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ddb2Q99J79 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ddb2Q99J79 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ddb2Q99J79 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ddb2Q99J79 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ddb2Q99J79 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ddb2Q99J79 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ddb2Q99J79 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ddb2Q99J79 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms