Protein–RNA interactions for Protein: Q99J38

Ttc30a1, Tetratricopeptide repeat protein 30A1, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc30a1Q99J38 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc30a1Q99J38 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms