Protein–RNA interactions for Protein: Q99388

Csprs, Component of Sp100-rs, mousemouse

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Length 208 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CsprsQ99388 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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CsprsQ99388 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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CsprsQ99388 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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CsprsQ99388 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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CsprsQ99388 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CsprsQ99388 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CsprsQ99388 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
CsprsQ99388 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CsprsQ99388 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms