Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR2

Snx18, Sorting nexin-18, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx18Q91ZR2 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Snx18Q91ZR2 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Snx18Q91ZR2 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Snx18Q91ZR2 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Snx18Q91ZR2 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Snx18Q91ZR2 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Snx18Q91ZR2 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Snx18Q91ZR2 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Snx18Q91ZR2 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Snx18Q91ZR2 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Snx18Q91ZR2 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Snx18Q91ZR2 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Snx18Q91ZR2 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Snx18Q91ZR2 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Snx18Q91ZR2 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Snx18Q91ZR2 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Snx18Q91ZR2 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Snx18Q91ZR2 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Snx18Q91ZR2 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Snx18Q91ZR2 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Snx18Q91ZR2 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Snx18Q91ZR2 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Snx18Q91ZR2 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Snx18Q91ZR2 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Snx18Q91ZR2 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Snx18Q91ZR2 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Snx18Q91ZR2 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Snx18Q91ZR2 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Snx18Q91ZR2 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Snx18Q91ZR2 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Snx18Q91ZR2 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Snx18Q91ZR2 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Snx18Q91ZR2 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Snx18Q91ZR2 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Snx18Q91ZR2 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Snx18Q91ZR2 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Snx18Q91ZR2 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Snx18Q91ZR2 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Snx18Q91ZR2 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Snx18Q91ZR2 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Snx18Q91ZR2 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Snx18Q91ZR2 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Snx18Q91ZR2 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Snx18Q91ZR2 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Snx18Q91ZR2 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Snx18Q91ZR2 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Snx18Q91ZR2 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Snx18Q91ZR2 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Snx18Q91ZR2 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Snx18Q91ZR2 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Snx18Q91ZR2 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Snx18Q91ZR2 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Snx18Q91ZR2 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Snx18Q91ZR2 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Snx18Q91ZR2 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Snx18Q91ZR2 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Snx18Q91ZR2 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Snx18Q91ZR2 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Snx18Q91ZR2 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Snx18Q91ZR2 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Snx18Q91ZR2 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Snx18Q91ZR2 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Snx18Q91ZR2 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Snx18Q91ZR2 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Snx18Q91ZR2 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Snx18Q91ZR2 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Snx18Q91ZR2 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Snx18Q91ZR2 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Snx18Q91ZR2 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Snx18Q91ZR2 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Snx18Q91ZR2 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Snx18Q91ZR2 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Snx18Q91ZR2 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Snx18Q91ZR2 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Snx18Q91ZR2 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Snx18Q91ZR2 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Snx18Q91ZR2 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Snx18Q91ZR2 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Snx18Q91ZR2 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Snx18Q91ZR2 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Snx18Q91ZR2 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Snx18Q91ZR2 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Snx18Q91ZR2 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Snx18Q91ZR2 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Snx18Q91ZR2 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Snx18Q91ZR2 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Snx18Q91ZR2 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Snx18Q91ZR2 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Snx18Q91ZR2 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Snx18Q91ZR2 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Snx18Q91ZR2 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Snx18Q91ZR2 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Snx18Q91ZR2 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Snx18Q91ZR2 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Snx18Q91ZR2 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Snx18Q91ZR2 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Snx18Q91ZR2 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Snx18Q91ZR2 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Snx18Q91ZR2 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Snx18Q91ZR2 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms