Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Gm5970-201ENSMUST00000131638 1216 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 1700066B17Rik-203ENSMUST00000191299 536 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Gm5708-201ENSMUST00000196289 886 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Gm40263-201ENSMUST00000197468 580 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Gm38217-201ENSMUST00000194358 910 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 4930550C14Rik-204ENSMUST00000217318 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Gm23757-201ENSMUST00000158353 100 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Ap1g1-206ENSMUST00000179104 1096 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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