Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms