Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT6

Apobr, Apolipoprotein B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobrQ8VBT6 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ApobrQ8VBT6 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ApobrQ8VBT6 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ApobrQ8VBT6 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ApobrQ8VBT6 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ApobrQ8VBT6 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ApobrQ8VBT6 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ApobrQ8VBT6 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ApobrQ8VBT6 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ApobrQ8VBT6 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ApobrQ8VBT6 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ApobrQ8VBT6 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ApobrQ8VBT6 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ApobrQ8VBT6 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ApobrQ8VBT6 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ApobrQ8VBT6 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ApobrQ8VBT6 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ApobrQ8VBT6 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ApobrQ8VBT6 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ApobrQ8VBT6 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ApobrQ8VBT6 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ApobrQ8VBT6 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ApobrQ8VBT6 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ApobrQ8VBT6 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ApobrQ8VBT6 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ApobrQ8VBT6 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ApobrQ8VBT6 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ApobrQ8VBT6 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ApobrQ8VBT6 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ApobrQ8VBT6 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ApobrQ8VBT6 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ApobrQ8VBT6 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ApobrQ8VBT6 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ApobrQ8VBT6 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ApobrQ8VBT6 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ApobrQ8VBT6 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ApobrQ8VBT6 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ApobrQ8VBT6 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms