Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc12Q8R344 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc12Q8R344 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc12Q8R344 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc12Q8R344 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc12Q8R344 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc12Q8R344 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc12Q8R344 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc12Q8R344 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc12Q8R344 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc12Q8R344 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc12Q8R344 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc12Q8R344 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc12Q8R344 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc12Q8R344 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc12Q8R344 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc12Q8R344 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc12Q8R344 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc12Q8R344 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc12Q8R344 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc12Q8R344 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc12Q8R344 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc12Q8R344 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc12Q8R344 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc12Q8R344 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc12Q8R344 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc12Q8R344 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc12Q8R344 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc12Q8R344 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc12Q8R344 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc12Q8R344 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc12Q8R344 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms