Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
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Vmn1r200Q8R281 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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Vmn1r200Q8R281 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
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Vmn1r200Q8R281 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Vmn1r200Q8R281 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r200Q8R281 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r200Q8R281 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r200Q8R281 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r200Q8R281 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Vmn1r200Q8R281 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r200Q8R281 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vmn1r200Q8R281 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vmn1r200Q8R281 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vmn1r200Q8R281 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vmn1r200Q8R281 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vmn1r200Q8R281 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vmn1r200Q8R281 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Vmn1r200Q8R281 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Vmn1r200Q8R281 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vmn1r200Q8R281 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vmn1r200Q8R281 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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