Protein–RNA interactions for Protein: Q8K411

Pitrm1, Presequence protease, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,036 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitrm1Q8K411 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pitrm1Q8K411 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pitrm1Q8K411 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pitrm1Q8K411 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pitrm1Q8K411 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pitrm1Q8K411 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pitrm1Q8K411 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pitrm1Q8K411 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pitrm1Q8K411 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pitrm1Q8K411 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pitrm1Q8K411 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pitrm1Q8K411 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pitrm1Q8K411 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pitrm1Q8K411 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pitrm1Q8K411 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pitrm1Q8K411 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pitrm1Q8K411 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pitrm1Q8K411 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pitrm1Q8K411 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pitrm1Q8K411 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pitrm1Q8K411 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pitrm1Q8K411 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pitrm1Q8K411 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pitrm1Q8K411 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pitrm1Q8K411 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pitrm1Q8K411 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pitrm1Q8K411 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pitrm1Q8K411 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Pitrm1Q8K411 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pitrm1Q8K411 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pitrm1Q8K411 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pitrm1Q8K411 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pitrm1Q8K411 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pitrm1Q8K411 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pitrm1Q8K411 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Pitrm1Q8K411 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pitrm1Q8K411 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pitrm1Q8K411 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pitrm1Q8K411 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pitrm1Q8K411 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pitrm1Q8K411 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pitrm1Q8K411 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pitrm1Q8K411 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pitrm1Q8K411 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pitrm1Q8K411 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Pitrm1Q8K411 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pitrm1Q8K411 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pitrm1Q8K411 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pitrm1Q8K411 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pitrm1Q8K411 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pitrm1Q8K411 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Pitrm1Q8K411 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pitrm1Q8K411 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pitrm1Q8K411 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pitrm1Q8K411 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Pitrm1Q8K411 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pitrm1Q8K411 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pitrm1Q8K411 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pitrm1Q8K411 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pitrm1Q8K411 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pitrm1Q8K411 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Pitrm1Q8K411 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pitrm1Q8K411 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pitrm1Q8K411 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pitrm1Q8K411 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pitrm1Q8K411 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pitrm1Q8K411 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms