Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms