Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Ssh3Q8K330 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Ssh3Q8K330 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms