Protein–RNA interactions for Protein: Q8K285

Fcho1, F-BAR domain only protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcho1Q8K285 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Fcho1Q8K285 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Fcho1Q8K285 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
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Fcho1Q8K285 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Fcho1Q8K285 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Fcho1Q8K285 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Fcho1Q8K285 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fcho1Q8K285 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fcho1Q8K285 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fcho1Q8K285 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fcho1Q8K285 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fcho1Q8K285 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fcho1Q8K285 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fcho1Q8K285 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fcho1Q8K285 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fcho1Q8K285 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms