Protein–RNA interactions for Protein: Q8K099

Lrit1, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 624 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit1Q8K099 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Rgs6-207ENSMUST00000186323 1308 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Lrit1Q8K099 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Lrit1Q8K099 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Lrit1Q8K099 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Lrit1Q8K099 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Lrit1Q8K099 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Lrit1Q8K099 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lrit1Q8K099 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrit1Q8K099 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Lrit1Q8K099 Gm7902-201ENSMUST00000198842 947 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
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Lrit1Q8K099 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrit1Q8K099 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrit1Q8K099 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Lrit1Q8K099 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrit1Q8K099 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrit1Q8K099 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrit1Q8K099 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrit1Q8K099 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrit1Q8K099 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrit1Q8K099 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrit1Q8K099 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrit1Q8K099 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrit1Q8K099 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrit1Q8K099 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrit1Q8K099 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrit1Q8K099 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrit1Q8K099 Gng12-205ENSMUST00000114226 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrit1Q8K099 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrit1Q8K099 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrit1Q8K099 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrit1Q8K099 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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