Protein–RNA interactions for Protein: Q8K045

Pkn3, Serine/threonine-protein kinase N3, mousemouse

Predictions only

Length 878 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn3Q8K045 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms