Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGV9

Tshz3, Teashirt homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,081 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tshz3Q8CGV9 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tshz3Q8CGV9 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tshz3Q8CGV9 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tshz3Q8CGV9 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tshz3Q8CGV9 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tshz3Q8CGV9 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tshz3Q8CGV9 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tshz3Q8CGV9 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tshz3Q8CGV9 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tshz3Q8CGV9 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tshz3Q8CGV9 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tshz3Q8CGV9 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tshz3Q8CGV9 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tshz3Q8CGV9 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tshz3Q8CGV9 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tshz3Q8CGV9 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tshz3Q8CGV9 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tshz3Q8CGV9 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tshz3Q8CGV9 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tshz3Q8CGV9 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tshz3Q8CGV9 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tshz3Q8CGV9 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tshz3Q8CGV9 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tshz3Q8CGV9 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tshz3Q8CGV9 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tshz3Q8CGV9 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tshz3Q8CGV9 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tshz3Q8CGV9 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tshz3Q8CGV9 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tshz3Q8CGV9 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tshz3Q8CGV9 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tshz3Q8CGV9 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tshz3Q8CGV9 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tshz3Q8CGV9 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tshz3Q8CGV9 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tshz3Q8CGV9 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tshz3Q8CGV9 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tshz3Q8CGV9 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tshz3Q8CGV9 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tshz3Q8CGV9 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tshz3Q8CGV9 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tshz3Q8CGV9 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tshz3Q8CGV9 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tshz3Q8CGV9 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tshz3Q8CGV9 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tshz3Q8CGV9 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tshz3Q8CGV9 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tshz3Q8CGV9 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tshz3Q8CGV9 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tshz3Q8CGV9 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tshz3Q8CGV9 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tshz3Q8CGV9 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tshz3Q8CGV9 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tshz3Q8CGV9 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tshz3Q8CGV9 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tshz3Q8CGV9 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tshz3Q8CGV9 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tshz3Q8CGV9 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tshz3Q8CGV9 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tshz3Q8CGV9 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tshz3Q8CGV9 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tshz3Q8CGV9 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tshz3Q8CGV9 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tshz3Q8CGV9 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tshz3Q8CGV9 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tshz3Q8CGV9 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Tshz3Q8CGV9 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tshz3Q8CGV9 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tshz3Q8CGV9 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tshz3Q8CGV9 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tshz3Q8CGV9 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tshz3Q8CGV9 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tshz3Q8CGV9 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tshz3Q8CGV9 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tshz3Q8CGV9 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tshz3Q8CGV9 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tshz3Q8CGV9 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tshz3Q8CGV9 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tshz3Q8CGV9 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tshz3Q8CGV9 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tshz3Q8CGV9 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tshz3Q8CGV9 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tshz3Q8CGV9 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tshz3Q8CGV9 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tshz3Q8CGV9 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tshz3Q8CGV9 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tshz3Q8CGV9 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tshz3Q8CGV9 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tshz3Q8CGV9 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tshz3Q8CGV9 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tshz3Q8CGV9 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tshz3Q8CGV9 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tshz3Q8CGV9 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tshz3Q8CGV9 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tshz3Q8CGV9 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tshz3Q8CGV9 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tshz3Q8CGV9 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Tshz3Q8CGV9 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.5 ms