Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Hpf1Q8CFE2 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hpf1Q8CFE2 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hpf1Q8CFE2 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hpf1Q8CFE2 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hpf1Q8CFE2 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hpf1Q8CFE2 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hpf1Q8CFE2 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
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Hpf1Q8CFE2 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
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Hpf1Q8CFE2 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hpf1Q8CFE2 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
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Hpf1Q8CFE2 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hpf1Q8CFE2 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hpf1Q8CFE2 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hpf1Q8CFE2 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hpf1Q8CFE2 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hpf1Q8CFE2 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hpf1Q8CFE2 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hpf1Q8CFE2 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hpf1Q8CFE2 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hpf1Q8CFE2 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hpf1Q8CFE2 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hpf1Q8CFE2 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hpf1Q8CFE2 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hpf1Q8CFE2 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hpf1Q8CFE2 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hpf1Q8CFE2 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hpf1Q8CFE2 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hpf1Q8CFE2 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hpf1Q8CFE2 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hpf1Q8CFE2 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hpf1Q8CFE2 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hpf1Q8CFE2 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hpf1Q8CFE2 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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