Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Ercc8Q8CFD5 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Ercc8Q8CFD5 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Ercc8Q8CFD5 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Ercc8Q8CFD5 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Ercc8Q8CFD5 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ercc8Q8CFD5 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
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