Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEJ8

Gm9955, Predicted gene 9955 (Fragment), mousemouse

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Length 102 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9955Q8CEJ8 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
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Gm9955Q8CEJ8 Zfp275-201ENSMUST00000033731 6376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 Ddx3x-201ENSMUST00000000804 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 Tln2-207ENSMUST00000215784 8330 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 Kif1b-203ENSMUST00000060537 10233 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 Ccdc186-202ENSMUST00000118592 6445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 G3bp1-201ENSMUST00000018727 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
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Gm9955Q8CEJ8 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
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Gm9955Q8CEJ8 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
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Gm9955Q8CEJ8 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
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Gm9955Q8CEJ8 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
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Gm9955Q8CEJ8 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
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Gm9955Q8CEJ8 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
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Gm9955Q8CEJ8 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 Mcc-201ENSMUST00000089874 7858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 Prdm10-204ENSMUST00000215499 6772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 Polr2a-201ENSMUST00000058470 6740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 Cacna1c-208ENSMUST00000187317 6663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
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