Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.3 ms