Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBA2

Slfn5, Schlafen family member 5, mousemouse

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Length 884 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn5Q8CBA2 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slfn5Q8CBA2 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slfn5Q8CBA2 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slfn5Q8CBA2 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slfn5Q8CBA2 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slfn5Q8CBA2 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slfn5Q8CBA2 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slfn5Q8CBA2 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slfn5Q8CBA2 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slfn5Q8CBA2 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slfn5Q8CBA2 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Slfn5Q8CBA2 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Slfn5Q8CBA2 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Slfn5Q8CBA2 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slfn5Q8CBA2 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slfn5Q8CBA2 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slfn5Q8CBA2 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slfn5Q8CBA2 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slfn5Q8CBA2 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slfn5Q8CBA2 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slfn5Q8CBA2 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slfn5Q8CBA2 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slfn5Q8CBA2 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slfn5Q8CBA2 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slfn5Q8CBA2 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slfn5Q8CBA2 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slfn5Q8CBA2 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slfn5Q8CBA2 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slfn5Q8CBA2 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slfn5Q8CBA2 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slfn5Q8CBA2 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slfn5Q8CBA2 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slfn5Q8CBA2 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slfn5Q8CBA2 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slfn5Q8CBA2 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slfn5Q8CBA2 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slfn5Q8CBA2 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Slfn5Q8CBA2 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Slfn5Q8CBA2 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Slfn5Q8CBA2 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slfn5Q8CBA2 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slfn5Q8CBA2 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Slfn5Q8CBA2 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Slfn5Q8CBA2 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slfn5Q8CBA2 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Slfn5Q8CBA2 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Slfn5Q8CBA2 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Slfn5Q8CBA2 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slfn5Q8CBA2 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slfn5Q8CBA2 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slfn5Q8CBA2 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slfn5Q8CBA2 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slfn5Q8CBA2 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slfn5Q8CBA2 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Slfn5Q8CBA2 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slfn5Q8CBA2 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slfn5Q8CBA2 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slfn5Q8CBA2 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Slfn5Q8CBA2 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slfn5Q8CBA2 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slfn5Q8CBA2 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slfn5Q8CBA2 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Slfn5Q8CBA2 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slfn5Q8CBA2 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Slfn5Q8CBA2 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Slfn5Q8CBA2 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Slfn5Q8CBA2 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Slfn5Q8CBA2 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Slfn5Q8CBA2 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Slfn5Q8CBA2 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Slfn5Q8CBA2 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Slfn5Q8CBA2 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Slfn5Q8CBA2 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Slfn5Q8CBA2 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Slfn5Q8CBA2 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Slfn5Q8CBA2 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Slfn5Q8CBA2 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Slfn5Q8CBA2 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Slfn5Q8CBA2 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Slfn5Q8CBA2 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Slfn5Q8CBA2 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Slfn5Q8CBA2 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Slfn5Q8CBA2 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Slfn5Q8CBA2 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Slfn5Q8CBA2 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Slfn5Q8CBA2 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Slfn5Q8CBA2 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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