Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXJ2

Trerf1, Transcriptional-regulating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trerf1Q8BXJ2 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trerf1Q8BXJ2 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trerf1Q8BXJ2 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trerf1Q8BXJ2 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trerf1Q8BXJ2 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trerf1Q8BXJ2 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trerf1Q8BXJ2 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trerf1Q8BXJ2 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trerf1Q8BXJ2 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trerf1Q8BXJ2 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trerf1Q8BXJ2 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trerf1Q8BXJ2 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Trerf1Q8BXJ2 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Trerf1Q8BXJ2 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Trerf1Q8BXJ2 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Trerf1Q8BXJ2 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trerf1Q8BXJ2 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trerf1Q8BXJ2 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trerf1Q8BXJ2 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trerf1Q8BXJ2 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trerf1Q8BXJ2 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trerf1Q8BXJ2 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trerf1Q8BXJ2 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Trerf1Q8BXJ2 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Trerf1Q8BXJ2 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trerf1Q8BXJ2 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trerf1Q8BXJ2 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trerf1Q8BXJ2 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trerf1Q8BXJ2 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trerf1Q8BXJ2 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trerf1Q8BXJ2 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trerf1Q8BXJ2 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trerf1Q8BXJ2 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trerf1Q8BXJ2 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Trerf1Q8BXJ2 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trerf1Q8BXJ2 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trerf1Q8BXJ2 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trerf1Q8BXJ2 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Trerf1Q8BXJ2 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trerf1Q8BXJ2 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trerf1Q8BXJ2 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trerf1Q8BXJ2 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Trerf1Q8BXJ2 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trerf1Q8BXJ2 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Trerf1Q8BXJ2 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Trerf1Q8BXJ2 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trerf1Q8BXJ2 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trerf1Q8BXJ2 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Trerf1Q8BXJ2 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trerf1Q8BXJ2 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
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Trerf1Q8BXJ2 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trerf1Q8BXJ2 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trerf1Q8BXJ2 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trerf1Q8BXJ2 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trerf1Q8BXJ2 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trerf1Q8BXJ2 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Trerf1Q8BXJ2 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trerf1Q8BXJ2 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trerf1Q8BXJ2 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trerf1Q8BXJ2 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trerf1Q8BXJ2 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trerf1Q8BXJ2 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trerf1Q8BXJ2 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trerf1Q8BXJ2 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trerf1Q8BXJ2 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trerf1Q8BXJ2 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Trerf1Q8BXJ2 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Trerf1Q8BXJ2 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trerf1Q8BXJ2 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trerf1Q8BXJ2 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trerf1Q8BXJ2 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trerf1Q8BXJ2 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
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