Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

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Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg4bQ8BGE6 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg4bQ8BGE6 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg4bQ8BGE6 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg4bQ8BGE6 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg4bQ8BGE6 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg4bQ8BGE6 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg4bQ8BGE6 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg4bQ8BGE6 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg4bQ8BGE6 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg4bQ8BGE6 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg4bQ8BGE6 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg4bQ8BGE6 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg4bQ8BGE6 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg4bQ8BGE6 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg4bQ8BGE6 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg4bQ8BGE6 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg4bQ8BGE6 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg4bQ8BGE6 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg4bQ8BGE6 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg4bQ8BGE6 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg4bQ8BGE6 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg4bQ8BGE6 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg4bQ8BGE6 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg4bQ8BGE6 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg4bQ8BGE6 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg4bQ8BGE6 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg4bQ8BGE6 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg4bQ8BGE6 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg4bQ8BGE6 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg4bQ8BGE6 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg4bQ8BGE6 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg4bQ8BGE6 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg4bQ8BGE6 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
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Atg4bQ8BGE6 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg4bQ8BGE6 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg4bQ8BGE6 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg4bQ8BGE6 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg4bQ8BGE6 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg4bQ8BGE6 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg4bQ8BGE6 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg4bQ8BGE6 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg4bQ8BGE6 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg4bQ8BGE6 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg4bQ8BGE6 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg4bQ8BGE6 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg4bQ8BGE6 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Atg4bQ8BGE6 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Atg4bQ8BGE6 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Atg4bQ8BGE6 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Atg4bQ8BGE6 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Atg4bQ8BGE6 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Atg4bQ8BGE6 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Atg4bQ8BGE6 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Atg4bQ8BGE6 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Atg4bQ8BGE6 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Atg4bQ8BGE6 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Atg4bQ8BGE6 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Atg4bQ8BGE6 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Atg4bQ8BGE6 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Atg4bQ8BGE6 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Atg4bQ8BGE6 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Atg4bQ8BGE6 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Atg4bQ8BGE6 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Atg4bQ8BGE6 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Atg4bQ8BGE6 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Atg4bQ8BGE6 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Atg4bQ8BGE6 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Atg4bQ8BGE6 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Atg4bQ8BGE6 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Atg4bQ8BGE6 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Atg4bQ8BGE6 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Atg4bQ8BGE6 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Atg4bQ8BGE6 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Atg4bQ8BGE6 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Atg4bQ8BGE6 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Atg4bQ8BGE6 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Atg4bQ8BGE6 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Atg4bQ8BGE6 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Atg4bQ8BGE6 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Atg4bQ8BGE6 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Atg4bQ8BGE6 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Atg4bQ8BGE6 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Atg4bQ8BGE6 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Atg4bQ8BGE6 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Atg4bQ8BGE6 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Atg4bQ8BGE6 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Atg4bQ8BGE6 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Atg4bQ8BGE6 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Atg4bQ8BGE6 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Atg4bQ8BGE6 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
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