Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms