Protein–RNA interactions for Protein: Q80US4

Actr5, Actin-related protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 605 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actr5Q80US4 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Actr5Q80US4 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Actr5Q80US4 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Actr5Q80US4 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Actr5Q80US4 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Actr5Q80US4 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Actr5Q80US4 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Actr5Q80US4 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Actr5Q80US4 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Actr5Q80US4 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Actr5Q80US4 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Actr5Q80US4 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Actr5Q80US4 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Actr5Q80US4 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Actr5Q80US4 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Actr5Q80US4 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Actr5Q80US4 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Actr5Q80US4 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Actr5Q80US4 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Actr5Q80US4 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Actr5Q80US4 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Actr5Q80US4 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Actr5Q80US4 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Actr5Q80US4 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Actr5Q80US4 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Actr5Q80US4 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Actr5Q80US4 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Actr5Q80US4 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Actr5Q80US4 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Actr5Q80US4 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Actr5Q80US4 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Actr5Q80US4 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Actr5Q80US4 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Actr5Q80US4 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Actr5Q80US4 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Actr5Q80US4 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Actr5Q80US4 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Actr5Q80US4 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Actr5Q80US4 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Actr5Q80US4 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Actr5Q80US4 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Actr5Q80US4 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Actr5Q80US4 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Actr5Q80US4 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Actr5Q80US4 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Actr5Q80US4 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Actr5Q80US4 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Actr5Q80US4 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Actr5Q80US4 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Actr5Q80US4 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Actr5Q80US4 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Actr5Q80US4 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Actr5Q80US4 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Actr5Q80US4 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Actr5Q80US4 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Actr5Q80US4 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Actr5Q80US4 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Actr5Q80US4 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Actr5Q80US4 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Actr5Q80US4 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Actr5Q80US4 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Actr5Q80US4 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Actr5Q80US4 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Actr5Q80US4 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Actr5Q80US4 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Actr5Q80US4 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Actr5Q80US4 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Actr5Q80US4 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Actr5Q80US4 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Actr5Q80US4 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Actr5Q80US4 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Actr5Q80US4 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Actr5Q80US4 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Actr5Q80US4 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Actr5Q80US4 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Actr5Q80US4 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Actr5Q80US4 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Actr5Q80US4 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Actr5Q80US4 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Actr5Q80US4 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Actr5Q80US4 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Actr5Q80US4 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Actr5Q80US4 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Actr5Q80US4 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Actr5Q80US4 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Actr5Q80US4 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Actr5Q80US4 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Actr5Q80US4 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Actr5Q80US4 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Actr5Q80US4 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Actr5Q80US4 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Actr5Q80US4 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Actr5Q80US4 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Actr5Q80US4 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Actr5Q80US4 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Actr5Q80US4 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Actr5Q80US4 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Actr5Q80US4 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Actr5Q80US4 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Actr5Q80US4 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.6 ms