Protein–RNA interactions for Protein: Q80U87

Usp8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,080 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp8Q80U87 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp8Q80U87 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp8Q80U87 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp8Q80U87 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp8Q80U87 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp8Q80U87 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Usp8Q80U87 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Usp8Q80U87 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Usp8Q80U87 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp8Q80U87 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Usp8Q80U87 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms