Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ube2q1Q7TSS2 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ube2q1Q7TSS2 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ube2q1Q7TSS2 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ube2q1Q7TSS2 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ube2q1Q7TSS2 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ube2q1Q7TSS2 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ube2q1Q7TSS2 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ube2q1Q7TSS2 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ube2q1Q7TSS2 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ube2q1Q7TSS2 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ube2q1Q7TSS2 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ube2q1Q7TSS2 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ube2q1Q7TSS2 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ube2q1Q7TSS2 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ube2q1Q7TSS2 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ube2q1Q7TSS2 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ube2q1Q7TSS2 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ube2q1Q7TSS2 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ube2q1Q7TSS2 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ube2q1Q7TSS2 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ube2q1Q7TSS2 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Ube2q1Q7TSS2 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ube2q1Q7TSS2 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ube2q1Q7TSS2 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ube2q1Q7TSS2 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ube2q1Q7TSS2 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ube2q1Q7TSS2 Gm25951-201ENSMUST00000175330 64 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Ube2q1Q7TSS2 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ube2q1Q7TSS2 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ube2q1Q7TSS2 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Ube2q1Q7TSS2 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ube2q1Q7TSS2 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ube2q1Q7TSS2 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ube2q1Q7TSS2 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ube2q1Q7TSS2 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ube2q1Q7TSS2 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ube2q1Q7TSS2 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ube2q1Q7TSS2 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ube2q1Q7TSS2 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Ube2q1Q7TSS2 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ube2q1Q7TSS2 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ube2q1Q7TSS2 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ube2q1Q7TSS2 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ube2q1Q7TSS2 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ube2q1Q7TSS2 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Ube2q1Q7TSS2 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ube2q1Q7TSS2 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ube2q1Q7TSS2 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ube2q1Q7TSS2 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ube2q1Q7TSS2 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ube2q1Q7TSS2 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ube2q1Q7TSS2 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ube2q1Q7TSS2 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ube2q1Q7TSS2 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ube2q1Q7TSS2 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ube2q1Q7TSS2 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ube2q1Q7TSS2 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ube2q1Q7TSS2 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ube2q1Q7TSS2 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Ube2q1Q7TSS2 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Ube2q1Q7TSS2 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ube2q1Q7TSS2 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Ube2q1Q7TSS2 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Ube2q1Q7TSS2 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ube2q1Q7TSS2 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Ube2q1Q7TSS2 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Ube2q1Q7TSS2 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ube2q1Q7TSS2 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ube2q1Q7TSS2 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Ube2q1Q7TSS2 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ube2q1Q7TSS2 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Ube2q1Q7TSS2 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ube2q1Q7TSS2 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ube2q1Q7TSS2 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Ube2q1Q7TSS2 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ube2q1Q7TSS2 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ube2q1Q7TSS2 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ube2q1Q7TSS2 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ube2q1Q7TSS2 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ube2q1Q7TSS2 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ube2q1Q7TSS2 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ube2q1Q7TSS2 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ube2q1Q7TSS2 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ube2q1Q7TSS2 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ube2q1Q7TSS2 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ube2q1Q7TSS2 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ube2q1Q7TSS2 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ube2q1Q7TSS2 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ube2q1Q7TSS2 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ube2q1Q7TSS2 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ube2q1Q7TSS2 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ube2q1Q7TSS2 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ube2q1Q7TSS2 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ube2q1Q7TSS2 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Ube2q1Q7TSS2 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ube2q1Q7TSS2 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ube2q1Q7TSS2 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ube2q1Q7TSS2 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ube2q1Q7TSS2 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms