Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Dsg1bQ7TSF1 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Dsg1bQ7TSF1 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Dsg1bQ7TSF1 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Dsg1bQ7TSF1 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Dsg1bQ7TSF1 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Dsg1bQ7TSF1 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Dsg1bQ7TSF1 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Dsg1bQ7TSF1 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Dsg1bQ7TSF1 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Dsg1bQ7TSF1 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Dsg1bQ7TSF1 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Dsg1bQ7TSF1 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Dsg1bQ7TSF1 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Dsg1bQ7TSF1 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Dsg1bQ7TSF1 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Dsg1bQ7TSF1 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Dsg1bQ7TSF1 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Dsg1bQ7TSF1 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Dsg1bQ7TSF1 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Dsg1bQ7TSF1 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Dsg1bQ7TSF1 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Dsg1bQ7TSF1 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Dsg1bQ7TSF1 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Dsg1bQ7TSF1 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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