Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
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Atp8b3Q6UQ17 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp8b3Q6UQ17 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Atp8b3Q6UQ17 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Atp8b3Q6UQ17 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp8b3Q6UQ17 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp8b3Q6UQ17 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp8b3Q6UQ17 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp8b3Q6UQ17 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp8b3Q6UQ17 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp8b3Q6UQ17 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp8b3Q6UQ17 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp8b3Q6UQ17 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Atp8b3Q6UQ17 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp8b3Q6UQ17 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp8b3Q6UQ17 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp8b3Q6UQ17 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp8b3Q6UQ17 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp8b3Q6UQ17 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp8b3Q6UQ17 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp8b3Q6UQ17 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp8b3Q6UQ17 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp8b3Q6UQ17 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp8b3Q6UQ17 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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