Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDE7

Ggt6, Glutathione hydrolase 6, mousemouse

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Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggt6Q6PDE7 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Ggt6Q6PDE7 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Ggt6Q6PDE7 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ggt6Q6PDE7 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Ggt6Q6PDE7 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
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Ggt6Q6PDE7 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Ggt6Q6PDE7 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ggt6Q6PDE7 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Ggt6Q6PDE7 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ggt6Q6PDE7 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Ggt6Q6PDE7 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ggt6Q6PDE7 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ggt6Q6PDE7 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ggt6Q6PDE7 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
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Ggt6Q6PDE7 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Ggt6Q6PDE7 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ggt6Q6PDE7 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ggt6Q6PDE7 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ggt6Q6PDE7 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ggt6Q6PDE7 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms