Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU8

Atg16l2, Autophagy-related protein 16-2, mousemouse

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Length 623 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l2Q6KAU8 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg16l2Q6KAU8 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg16l2Q6KAU8 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg16l2Q6KAU8 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg16l2Q6KAU8 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg16l2Q6KAU8 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg16l2Q6KAU8 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Atg16l2Q6KAU8 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Atg16l2Q6KAU8 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC13□□□□□ -0.33
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Atg16l2Q6KAU8 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg16l2Q6KAU8 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg16l2Q6KAU8 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Atg16l2Q6KAU8 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg16l2Q6KAU8 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Atg16l2Q6KAU8 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg16l2Q6KAU8 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Atg16l2Q6KAU8 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg16l2Q6KAU8 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Atg16l2Q6KAU8 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Atg16l2Q6KAU8 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg16l2Q6KAU8 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg16l2Q6KAU8 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg16l2Q6KAU8 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg16l2Q6KAU8 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg16l2Q6KAU8 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg16l2Q6KAU8 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg16l2Q6KAU8 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg16l2Q6KAU8 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg16l2Q6KAU8 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Atg16l2Q6KAU8 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Atg16l2Q6KAU8 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Atg16l2Q6KAU8 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Atg16l2Q6KAU8 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Atg16l2Q6KAU8 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg16l2Q6KAU8 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg16l2Q6KAU8 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg16l2Q6KAU8 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg16l2Q6KAU8 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg16l2Q6KAU8 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg16l2Q6KAU8 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg16l2Q6KAU8 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg16l2Q6KAU8 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg16l2Q6KAU8 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg16l2Q6KAU8 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg16l2Q6KAU8 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg16l2Q6KAU8 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg16l2Q6KAU8 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg16l2Q6KAU8 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg16l2Q6KAU8 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg16l2Q6KAU8 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms