Protein–RNA interactions for Protein: Q6BCL1

Pram1, PML-RARA-regulated adapter molecule 1, mousemouse

Predictions only

Length 675 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pram1Q6BCL1 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pram1Q6BCL1 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pram1Q6BCL1 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pram1Q6BCL1 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pram1Q6BCL1 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pram1Q6BCL1 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pram1Q6BCL1 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pram1Q6BCL1 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pram1Q6BCL1 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pram1Q6BCL1 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pram1Q6BCL1 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pram1Q6BCL1 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pram1Q6BCL1 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pram1Q6BCL1 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pram1Q6BCL1 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pram1Q6BCL1 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pram1Q6BCL1 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pram1Q6BCL1 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pram1Q6BCL1 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pram1Q6BCL1 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pram1Q6BCL1 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pram1Q6BCL1 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pram1Q6BCL1 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pram1Q6BCL1 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pram1Q6BCL1 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pram1Q6BCL1 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pram1Q6BCL1 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pram1Q6BCL1 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pram1Q6BCL1 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pram1Q6BCL1 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pram1Q6BCL1 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pram1Q6BCL1 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pram1Q6BCL1 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pram1Q6BCL1 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pram1Q6BCL1 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pram1Q6BCL1 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pram1Q6BCL1 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pram1Q6BCL1 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pram1Q6BCL1 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pram1Q6BCL1 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pram1Q6BCL1 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pram1Q6BCL1 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pram1Q6BCL1 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pram1Q6BCL1 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pram1Q6BCL1 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pram1Q6BCL1 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pram1Q6BCL1 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pram1Q6BCL1 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pram1Q6BCL1 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pram1Q6BCL1 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pram1Q6BCL1 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pram1Q6BCL1 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pram1Q6BCL1 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pram1Q6BCL1 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pram1Q6BCL1 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pram1Q6BCL1 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pram1Q6BCL1 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pram1Q6BCL1 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pram1Q6BCL1 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pram1Q6BCL1 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pram1Q6BCL1 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pram1Q6BCL1 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pram1Q6BCL1 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pram1Q6BCL1 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pram1Q6BCL1 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pram1Q6BCL1 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pram1Q6BCL1 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pram1Q6BCL1 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pram1Q6BCL1 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pram1Q6BCL1 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pram1Q6BCL1 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pram1Q6BCL1 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pram1Q6BCL1 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pram1Q6BCL1 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pram1Q6BCL1 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pram1Q6BCL1 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pram1Q6BCL1 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pram1Q6BCL1 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pram1Q6BCL1 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pram1Q6BCL1 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pram1Q6BCL1 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pram1Q6BCL1 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pram1Q6BCL1 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pram1Q6BCL1 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pram1Q6BCL1 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pram1Q6BCL1 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pram1Q6BCL1 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pram1Q6BCL1 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pram1Q6BCL1 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pram1Q6BCL1 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pram1Q6BCL1 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pram1Q6BCL1 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pram1Q6BCL1 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pram1Q6BCL1 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pram1Q6BCL1 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pram1Q6BCL1 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pram1Q6BCL1 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pram1Q6BCL1 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pram1Q6BCL1 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pram1Q6BCL1 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms