Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZP3

Pnkd, Probable hydrolase PNKD, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnkdQ69ZP3 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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PnkdQ69ZP3 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PnkdQ69ZP3 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PnkdQ69ZP3 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PnkdQ69ZP3 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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PnkdQ69ZP3 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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PnkdQ69ZP3 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PnkdQ69ZP3 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PnkdQ69ZP3 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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PnkdQ69ZP3 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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PnkdQ69ZP3 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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PnkdQ69ZP3 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PnkdQ69ZP3 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PnkdQ69ZP3 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PnkdQ69ZP3 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PnkdQ69ZP3 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PnkdQ69ZP3 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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PnkdQ69ZP3 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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PnkdQ69ZP3 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PnkdQ69ZP3 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PnkdQ69ZP3 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
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PnkdQ69ZP3 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PnkdQ69ZP3 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PnkdQ69ZP3 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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PnkdQ69ZP3 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
PnkdQ69ZP3 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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PnkdQ69ZP3 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PnkdQ69ZP3 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PnkdQ69ZP3 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PnkdQ69ZP3 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
PnkdQ69ZP3 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PnkdQ69ZP3 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PnkdQ69ZP3 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PnkdQ69ZP3 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PnkdQ69ZP3 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PnkdQ69ZP3 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PnkdQ69ZP3 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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PnkdQ69ZP3 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PnkdQ69ZP3 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PnkdQ69ZP3 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
PnkdQ69ZP3 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PnkdQ69ZP3 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PnkdQ69ZP3 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
PnkdQ69ZP3 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
PnkdQ69ZP3 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
PnkdQ69ZP3 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PnkdQ69ZP3 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PnkdQ69ZP3 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PnkdQ69ZP3 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PnkdQ69ZP3 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PnkdQ69ZP3 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PnkdQ69ZP3 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PnkdQ69ZP3 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PnkdQ69ZP3 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms