Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

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Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctnna3Q65CL1 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctnna3Q65CL1 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctnna3Q65CL1 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctnna3Q65CL1 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctnna3Q65CL1 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctnna3Q65CL1 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctnna3Q65CL1 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctnna3Q65CL1 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctnna3Q65CL1 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctnna3Q65CL1 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctnna3Q65CL1 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctnna3Q65CL1 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctnna3Q65CL1 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctnna3Q65CL1 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctnna3Q65CL1 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctnna3Q65CL1 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctnna3Q65CL1 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctnna3Q65CL1 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctnna3Q65CL1 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctnna3Q65CL1 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctnna3Q65CL1 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctnna3Q65CL1 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctnna3Q65CL1 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctnna3Q65CL1 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctnna3Q65CL1 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctnna3Q65CL1 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctnna3Q65CL1 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctnna3Q65CL1 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctnna3Q65CL1 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctnna3Q65CL1 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctnna3Q65CL1 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctnna3Q65CL1 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctnna3Q65CL1 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctnna3Q65CL1 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctnna3Q65CL1 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctnna3Q65CL1 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctnna3Q65CL1 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctnna3Q65CL1 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctnna3Q65CL1 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctnna3Q65CL1 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctnna3Q65CL1 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctnna3Q65CL1 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctnna3Q65CL1 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ctnna3Q65CL1 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ctnna3Q65CL1 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ctnna3Q65CL1 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ctnna3Q65CL1 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ctnna3Q65CL1 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ctnna3Q65CL1 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ctnna3Q65CL1 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ctnna3Q65CL1 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ctnna3Q65CL1 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ctnna3Q65CL1 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ctnna3Q65CL1 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ctnna3Q65CL1 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ctnna3Q65CL1 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ctnna3Q65CL1 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ctnna3Q65CL1 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ctnna3Q65CL1 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ctnna3Q65CL1 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ctnna3Q65CL1 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ctnna3Q65CL1 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ctnna3Q65CL1 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Ctnna3Q65CL1 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ctnna3Q65CL1 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ctnna3Q65CL1 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ctnna3Q65CL1 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ctnna3Q65CL1 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ctnna3Q65CL1 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Ctnna3Q65CL1 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ctnna3Q65CL1 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ctnna3Q65CL1 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ctnna3Q65CL1 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ctnna3Q65CL1 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ctnna3Q65CL1 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ctnna3Q65CL1 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ctnna3Q65CL1 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ctnna3Q65CL1 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ctnna3Q65CL1 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ctnna3Q65CL1 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ctnna3Q65CL1 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ctnna3Q65CL1 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ctnna3Q65CL1 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ctnna3Q65CL1 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ctnna3Q65CL1 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ctnna3Q65CL1 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ctnna3Q65CL1 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ctnna3Q65CL1 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ctnna3Q65CL1 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ctnna3Q65CL1 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ctnna3Q65CL1 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ctnna3Q65CL1 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ctnna3Q65CL1 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ctnna3Q65CL1 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ctnna3Q65CL1 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ctnna3Q65CL1 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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