Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc18Q640L5 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc18Q640L5 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc18Q640L5 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc18Q640L5 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc18Q640L5 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc18Q640L5 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc18Q640L5 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc18Q640L5 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc18Q640L5 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc18Q640L5 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc18Q640L5 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc18Q640L5 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc18Q640L5 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc18Q640L5 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc18Q640L5 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
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Ccdc18Q640L5 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc18Q640L5 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc18Q640L5 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc18Q640L5 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc18Q640L5 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc18Q640L5 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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Ccdc18Q640L5 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc18Q640L5 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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Ccdc18Q640L5 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc18Q640L5 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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Ccdc18Q640L5 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc18Q640L5 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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Ccdc18Q640L5 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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Ccdc18Q640L5 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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Ccdc18Q640L5 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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Ccdc18Q640L5 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc18Q640L5 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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Ccdc18Q640L5 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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Ccdc18Q640L5 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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Ccdc18Q640L5 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc18Q640L5 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc18Q640L5 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc18Q640L5 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc18Q640L5 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc18Q640L5 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc18Q640L5 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc18Q640L5 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc18Q640L5 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc18Q640L5 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc18Q640L5 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc18Q640L5 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc18Q640L5 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc18Q640L5 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc18Q640L5 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc18Q640L5 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc18Q640L5 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc18Q640L5 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc18Q640L5 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc18Q640L5 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc18Q640L5 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
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