Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Anapc16-203ENSMUST00000182152 847 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Arhgef33-207ENSMUST00000224966 490 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Mir671-201ENSMUST00000102432 98 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms