Protein–RNA interactions for Protein: Q62311

Taf6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf6Q62311 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Taf6Q62311 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Taf6Q62311 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Taf6Q62311 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Taf6Q62311 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Taf6Q62311 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Taf6Q62311 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Taf6Q62311 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Taf6Q62311 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Taf6Q62311 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Taf6Q62311 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Taf6Q62311 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Taf6Q62311 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Taf6Q62311 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Taf6Q62311 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Taf6Q62311 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Taf6Q62311 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Taf6Q62311 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Taf6Q62311 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Taf6Q62311 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Taf6Q62311 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Taf6Q62311 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Taf6Q62311 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Taf6Q62311 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Taf6Q62311 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Taf6Q62311 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Taf6Q62311 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Taf6Q62311 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Taf6Q62311 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Taf6Q62311 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Taf6Q62311 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Taf6Q62311 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Taf6Q62311 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Taf6Q62311 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Taf6Q62311 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Taf6Q62311 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Taf6Q62311 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Taf6Q62311 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Taf6Q62311 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Taf6Q62311 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Taf6Q62311 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Taf6Q62311 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms