Protein–RNA interactions for Protein: Q61635

Ifi47, GTP-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi47Q61635 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Ifi47Q61635 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Ifi47Q61635 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Ifi47Q61635 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ifi47Q61635 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ifi47Q61635 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Ifi47Q61635 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ifi47Q61635 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ifi47Q61635 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ifi47Q61635 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms