Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms