Protein–RNA interactions for Protein: Q61345

Foxd1, Forkhead box protein D1, mousemouse

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Length 456 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd1Q61345 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Foxd1Q61345 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
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Foxd1Q61345 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Foxd1Q61345 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Foxd1Q61345 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Foxd1Q61345 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Foxd1Q61345 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Foxd1Q61345 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Foxd1Q61345 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Foxd1Q61345 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Foxd1Q61345 Fam114a2-202ENSMUST00000108850 1765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Foxd1Q61345 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Foxd1Q61345 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Foxd1Q61345 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Foxd1Q61345 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Foxd1Q61345 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Foxd1Q61345 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
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Foxd1Q61345 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Foxd1Q61345 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Foxd1Q61345 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Foxd1Q61345 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Foxd1Q61345 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Foxd1Q61345 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Foxd1Q61345 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Foxd1Q61345 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Foxd1Q61345 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Foxd1Q61345 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Foxd1Q61345 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Foxd1Q61345 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Foxd1Q61345 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Foxd1Q61345 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Foxd1Q61345 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Foxd1Q61345 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Foxd1Q61345 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Foxd1Q61345 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Foxd1Q61345 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Foxd1Q61345 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Foxd1Q61345 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Foxd1Q61345 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Foxd1Q61345 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Foxd1Q61345 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Foxd1Q61345 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Foxd1Q61345 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Foxd1Q61345 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Foxd1Q61345 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Foxd1Q61345 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Foxd1Q61345 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Foxd1Q61345 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Foxd1Q61345 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Foxd1Q61345 Gm4862-201ENSMUST00000170405 438 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Foxd1Q61345 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Foxd1Q61345 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
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Foxd1Q61345 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
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