Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Klf3Q60980 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms