Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mkrn3Q60764 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mkrn3Q60764 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mkrn3Q60764 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mkrn3Q60764 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mkrn3Q60764 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mkrn3Q60764 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mkrn3Q60764 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mkrn3Q60764 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mkrn3Q60764 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Mkrn3Q60764 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mkrn3Q60764 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mkrn3Q60764 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mkrn3Q60764 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mkrn3Q60764 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mkrn3Q60764 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mkrn3Q60764 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mkrn3Q60764 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mkrn3Q60764 Gm38368-201ENSMUST00000193181 1335 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Mkrn3Q60764 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mkrn3Q60764 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mkrn3Q60764 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mkrn3Q60764 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Mkrn3Q60764 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mkrn3Q60764 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mkrn3Q60764 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mkrn3Q60764 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mkrn3Q60764 Gm14579-201ENSMUST00000117068 283 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Mkrn3Q60764 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mkrn3Q60764 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mkrn3Q60764 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mkrn3Q60764 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mkrn3Q60764 AC158142.3-201ENSMUST00000226230 675 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Mkrn3Q60764 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Mkrn3Q60764 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mkrn3Q60764 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mkrn3Q60764 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mkrn3Q60764 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mkrn3Q60764 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mkrn3Q60764 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mkrn3Q60764 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mkrn3Q60764 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mkrn3Q60764 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mkrn3Q60764 Gm37234-201ENSMUST00000193259 1441 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Mkrn3Q60764 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mkrn3Q60764 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mkrn3Q60764 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mkrn3Q60764 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mkrn3Q60764 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mkrn3Q60764 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Mkrn3Q60764 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mkrn3Q60764 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mkrn3Q60764 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mkrn3Q60764 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mkrn3Q60764 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mkrn3Q60764 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mkrn3Q60764 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mkrn3Q60764 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mkrn3Q60764 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mkrn3Q60764 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mkrn3Q60764 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mkrn3Q60764 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mkrn3Q60764 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mkrn3Q60764 Snrnp27-201ENSMUST00000001186 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mkrn3Q60764 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Mkrn3Q60764 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mkrn3Q60764 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mkrn3Q60764 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mkrn3Q60764 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mkrn3Q60764 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mkrn3Q60764 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Mkrn3Q60764 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mkrn3Q60764 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Mkrn3Q60764 Gm19885-201ENSMUST00000212853 343 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Mkrn3Q60764 AC153897.1-201ENSMUST00000213510 470 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mkrn3Q60764 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mkrn3Q60764 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mkrn3Q60764 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mkrn3Q60764 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Mkrn3Q60764 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mkrn3Q60764 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mkrn3Q60764 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mkrn3Q60764 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mkrn3Q60764 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mkrn3Q60764 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mkrn3Q60764 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mkrn3Q60764 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mkrn3Q60764 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mkrn3Q60764 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mkrn3Q60764 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mkrn3Q60764 Gm43216-201ENSMUST00000196295 1333 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Mkrn3Q60764 Milr1-201ENSMUST00000086353 1348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mkrn3Q60764 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mkrn3Q60764 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mkrn3Q60764 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mkrn3Q60764 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mkrn3Q60764 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mkrn3Q60764 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms