Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms