Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Olfr181-203ENSMUST00000205742 1104 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Ranbp1-201ENSMUST00000052325 923 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Spink11-201ENSMUST00000097587 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Pbdc1-202ENSMUST00000119477 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Gm20778-201ENSMUST00000178524 627 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 4921511E07Rik-201ENSMUST00000194790 827 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 5033424D13Rik-201ENSMUST00000221779 648 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 AC140368.1-202ENSMUST00000226131 658 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Ptma-201ENSMUST00000045897 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Gm26563-202ENSMUST00000181152 1931 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 RMST_1.1-211ENSMUST00000219726 783 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxd4Q60688 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms