Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPL2

Phf12, PHD finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf12Q5SPL2 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 4933439N06Rik-201ENSMUST00000203062 1365 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Gm34816-201ENSMUST00000193363 502 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Gm45151-201ENSMUST00000205445 712 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Cnbd1-201ENSMUST00000137780 1331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Gm15061-201ENSMUST00000121076 1046 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Gm15940-201ENSMUST00000156011 817 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Gm8581-201ENSMUST00000188636 890 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Phf12Q5SPL2 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms