Protein–RNA interactions for Protein: Q56A10

Znf608, Zinc finger protein 608, mousemouse

Predictions only

Length 1,511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf608Q56A10 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Znf608Q56A10 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Znf608Q56A10 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Znf608Q56A10 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Znf608Q56A10 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Znf608Q56A10 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Znf608Q56A10 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Znf608Q56A10 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Znf608Q56A10 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Znf608Q56A10 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Znf608Q56A10 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Znf608Q56A10 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Znf608Q56A10 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Znf608Q56A10 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Znf608Q56A10 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Znf608Q56A10 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Znf608Q56A10 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Znf608Q56A10 Gm13278-201ENSMUST00000177771 549 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Znf608Q56A10 Gm13275-201ENSMUST00000178347 549 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Znf608Q56A10 Gm13277-201ENSMUST00000178480 549 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Znf608Q56A10 Gm13279-201ENSMUST00000178602 549 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Znf608Q56A10 Gm13289-201ENSMUST00000179158 549 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Znf608Q56A10 Gm13276-201ENSMUST00000179372 549 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Znf608Q56A10 Gm13287-201ENSMUST00000179490 549 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Znf608Q56A10 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Znf608Q56A10 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Znf608Q56A10 Gm18460-201ENSMUST00000208088 464 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Znf608Q56A10 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Znf608Q56A10 Gm7959-201ENSMUST00000221823 1078 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Znf608Q56A10 Gm13271-201ENSMUST00000094992 549 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Znf608Q56A10 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Znf608Q56A10 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Znf608Q56A10 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Znf608Q56A10 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Znf608Q56A10 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Znf608Q56A10 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Znf608Q56A10 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Znf608Q56A10 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Znf608Q56A10 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Znf608Q56A10 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Znf608Q56A10 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Znf608Q56A10 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Znf608Q56A10 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Znf608Q56A10 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Znf608Q56A10 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Znf608Q56A10 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Znf608Q56A10 Gm45500-201ENSMUST00000211676 803 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Znf608Q56A10 AC168279.1-201ENSMUST00000214611 382 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Znf608Q56A10 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Znf608Q56A10 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Znf608Q56A10 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Znf608Q56A10 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Znf608Q56A10 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Znf608Q56A10 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Znf608Q56A10 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Znf608Q56A10 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Znf608Q56A10 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Znf608Q56A10 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Znf608Q56A10 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Znf608Q56A10 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Znf608Q56A10 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Znf608Q56A10 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Znf608Q56A10 2610301B20Rik-202ENSMUST00000101504 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Znf608Q56A10 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Znf608Q56A10 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Znf608Q56A10 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Znf608Q56A10 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Znf608Q56A10 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Znf608Q56A10 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Znf608Q56A10 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Znf608Q56A10 Rps10-ps1-201ENSMUST00000074353 495 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Znf608Q56A10 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Znf608Q56A10 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Znf608Q56A10 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Znf608Q56A10 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Znf608Q56A10 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Znf608Q56A10 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Znf608Q56A10 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Znf608Q56A10 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Znf608Q56A10 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Znf608Q56A10 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Znf608Q56A10 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Znf608Q56A10 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Znf608Q56A10 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Znf608Q56A10 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Znf608Q56A10 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Znf608Q56A10 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms