Protein–RNA interactions for Protein: Q504M2

Pdp2, MCG53395, mousemouse

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdp2Q504M2 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pdp2Q504M2 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pdp2Q504M2 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pdp2Q504M2 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pdp2Q504M2 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pdp2Q504M2 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pdp2Q504M2 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pdp2Q504M2 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pdp2Q504M2 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pdp2Q504M2 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pdp2Q504M2 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pdp2Q504M2 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pdp2Q504M2 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Pdp2Q504M2 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pdp2Q504M2 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pdp2Q504M2 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pdp2Q504M2 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pdp2Q504M2 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Pdp2Q504M2 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pdp2Q504M2 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Pdp2Q504M2 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pdp2Q504M2 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Pdp2Q504M2 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pdp2Q504M2 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pdp2Q504M2 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pdp2Q504M2 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pdp2Q504M2 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pdp2Q504M2 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pdp2Q504M2 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pdp2Q504M2 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pdp2Q504M2 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pdp2Q504M2 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pdp2Q504M2 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pdp2Q504M2 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pdp2Q504M2 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pdp2Q504M2 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pdp2Q504M2 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Pdp2Q504M2 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Pdp2Q504M2 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Pdp2Q504M2 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdp2Q504M2 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdp2Q504M2 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdp2Q504M2 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdp2Q504M2 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdp2Q504M2 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdp2Q504M2 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdp2Q504M2 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdp2Q504M2 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdp2Q504M2 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdp2Q504M2 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdp2Q504M2 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Pdp2Q504M2 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdp2Q504M2 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdp2Q504M2 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdp2Q504M2 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdp2Q504M2 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Pdp2Q504M2 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdp2Q504M2 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Pdp2Q504M2 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdp2Q504M2 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdp2Q504M2 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdp2Q504M2 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdp2Q504M2 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdp2Q504M2 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdp2Q504M2 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdp2Q504M2 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdp2Q504M2 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdp2Q504M2 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdp2Q504M2 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdp2Q504M2 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdp2Q504M2 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdp2Q504M2 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pdp2Q504M2 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Pdp2Q504M2 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pdp2Q504M2 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pdp2Q504M2 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pdp2Q504M2 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pdp2Q504M2 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Pdp2Q504M2 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pdp2Q504M2 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pdp2Q504M2 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pdp2Q504M2 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pdp2Q504M2 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pdp2Q504M2 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pdp2Q504M2 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pdp2Q504M2 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Pdp2Q504M2 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pdp2Q504M2 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms