Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Gm42779-201ENSMUST00000198807 406 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Gm8894-201ENSMUST00000074642 666 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
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