Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0Q1

Dnah12, Dynein heavy chain 12, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 3,086 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnah12Q3V0Q1 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Dnah12Q3V0Q1 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Dnah12Q3V0Q1 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Dnah12Q3V0Q1 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Dnah12Q3V0Q1 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Dnah12Q3V0Q1 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Dnah12Q3V0Q1 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Dnah12Q3V0Q1 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Dnah12Q3V0Q1 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Dnah12Q3V0Q1 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Dnah12Q3V0Q1 Gm42779-201ENSMUST00000198807 406 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Dnah12Q3V0Q1 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Dnah12Q3V0Q1 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Dnah12Q3V0Q1 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Dnah12Q3V0Q1 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Dnah12Q3V0Q1 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Dnah12Q3V0Q1 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Dnah12Q3V0Q1 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Dnah12Q3V0Q1 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Dnah12Q3V0Q1 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Dnah12Q3V0Q1 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Dnah12Q3V0Q1 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Dnah12Q3V0Q1 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Dnah12Q3V0Q1 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Dnah12Q3V0Q1 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Dnah12Q3V0Q1 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Dnah12Q3V0Q1 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Dnah12Q3V0Q1 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Dnah12Q3V0Q1 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Dnah12Q3V0Q1 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Dnah12Q3V0Q1 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Dnah12Q3V0Q1 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Dnah12Q3V0Q1 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Dnah12Q3V0Q1 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Dnah12Q3V0Q1 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Dnah12Q3V0Q1 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Dnah12Q3V0Q1 Gm11354-201ENSMUST00000121974 422 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Dnah12Q3V0Q1 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Dnah12Q3V0Q1 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Dnah12Q3V0Q1 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Dnah12Q3V0Q1 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Dnah12Q3V0Q1 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Dnah12Q3V0Q1 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Dnah12Q3V0Q1 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Dnah12Q3V0Q1 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Dnah12Q3V0Q1 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Dnah12Q3V0Q1 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Dnah12Q3V0Q1 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Dnah12Q3V0Q1 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Dnah12Q3V0Q1 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Dnah12Q3V0Q1 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Dnah12Q3V0Q1 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Dnah12Q3V0Q1 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Dnah12Q3V0Q1 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Dnah12Q3V0Q1 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Dnah12Q3V0Q1 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Dnah12Q3V0Q1 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Dnah12Q3V0Q1 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Dnah12Q3V0Q1 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Dnah12Q3V0Q1 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Dnah12Q3V0Q1 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Dnah12Q3V0Q1 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Dnah12Q3V0Q1 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Dnah12Q3V0Q1 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Dnah12Q3V0Q1 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Dnah12Q3V0Q1 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Dnah12Q3V0Q1 Spata3-207ENSMUST00000135440 732 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Dnah12Q3V0Q1 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Dnah12Q3V0Q1 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Dnah12Q3V0Q1 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Dnah12Q3V0Q1 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Dnah12Q3V0Q1 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Dnah12Q3V0Q1 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Dnah12Q3V0Q1 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Dnah12Q3V0Q1 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Dnah12Q3V0Q1 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Dnah12Q3V0Q1 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Dnah12Q3V0Q1 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Dnah12Q3V0Q1 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Dnah12Q3V0Q1 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Dnah12Q3V0Q1 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Dnah12Q3V0Q1 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Dnah12Q3V0Q1 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Dnah12Q3V0Q1 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Dnah12Q3V0Q1 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Dnah12Q3V0Q1 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Dnah12Q3V0Q1 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Dnah12Q3V0Q1 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Dnah12Q3V0Q1 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Dnah12Q3V0Q1 Mir671-201ENSMUST00000102432 98 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Dnah12Q3V0Q1 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Dnah12Q3V0Q1 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Dnah12Q3V0Q1 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Dnah12Q3V0Q1 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Dnah12Q3V0Q1 Gm5434-202ENSMUST00000222384 1451 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Dnah12Q3V0Q1 Gm5434-201ENSMUST00000071825 1451 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Dnah12Q3V0Q1 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Dnah12Q3V0Q1 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Dnah12Q3V0Q1 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Dnah12Q3V0Q1 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms