Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW13

D130052B06Rik, RIKEN cDNA D130052B06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130052B06RikQ3UW13 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Pcdh18-201ENSMUST00000035931 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Zzef1-208ENSMUST00000207107 11306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Myh4-201ENSMUST00000018632 6016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC8.79□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Fam53c-202ENSMUST00000097622 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC8.79□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Bicral-201ENSMUST00000040624 6579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC8.79□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.79□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC8.79□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC8.79□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Cadm2-201ENSMUST00000114292 9564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC8.79□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Cdc42bpa-203ENSMUST00000097453 6704 ntTSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Epb41-202ENSMUST00000054917 4948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Thsd4-201ENSMUST00000034829 4816 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Gne-201ENSMUST00000030201 5384 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Zfp804b-202ENSMUST00000200317 4430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC8.79□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Mcm3ap-201ENSMUST00000170795 6427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Jmjd4-201ENSMUST00000045279 4315 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Bmpr2-201ENSMUST00000087435 12899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Svil-211ENSMUST00000143254 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC8.78□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Rpgrip1-201ENSMUST00000111600 4565 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Pcdh11x-202ENSMUST00000113358 8607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.78□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC8.78□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC8.78□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Rbbp6-201ENSMUST00000052135 6184 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Tsc1-204ENSMUST00000113870 7595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC8.78□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.4 ms